2023 Autorius: Christopher Dowman | [email protected]. Paskutinį kartą keistas: 2023-05-24 14:06
Masačusetso bendrosios ligoninės (MGH) vėžio centro mokslininkai atrado anksčiau nežinomą įprastų naviko ląstelių požymį – didžiulę tam tikrų DNR sekų, kurios nekoduoja baltymų, ekspresiją. Šios DNR sekos, vadinamos palydoviniais pasikartojimais, buvo tiriamos dėl jų vaidmens chromosomų struktūroje, tačiau anksčiau nebuvo įtariama, kad jos gali turėti įtakos vėžiui. Ataskaita bus paskelbta žurnale „Science“ir anksti bus paskelbta internete.
„Palydoviniai pasikartojimai sudaro didelę mūsų genomo dalį, tačiau buvo manoma, kad jie yra neaktyvūs“, – aiškina Davidas Tingas, medicinos mokslų daktaras iš MGH vėžio centro, vienas iš mokslo darbų autorių. "Mes nustatėme, kad šie regionai iš tikrųjų yra labai aktyvūs vėžiui, bet ne normaliuose audiniuose. Išvados gali suteikti mums naują vėžio biomarkerį, taip pat naujų įžvalgų apie vėžio elgesį."
Kadangi anksčiau prieinami įrankiai, skirti DNR transkripcijai į RNR analizuoti, buvo sukurti taip, kad sutelktų dėmesį į sekas, kurios galiausiai paverčiamos baltymais, jie neįtraukė segmentų, esančių daugkartinėse kopijose, kurios negamina baltymų. Tarp šių DNR ruožų yra palydoviniai pasikartojimai, pasikartojančios sekos, dažnai randamos netoli chromosomų centrų ar galiukų. Reikšminga palydovinių pasikartojimų ekspresija anksčiau buvo pastebėta tik embrioniniuose audiniuose arba embrioninėse kamieninėse ląstelėse.
Dabartinis tyrimas buvo sukurtas siekiant pateikti išsamesnį pirminių navikų transkripto vaizdą - visą RNR molekulių spektrą. Naudodama pažangią skaitmeninę genų ekspresijos analizės sistemą, vadinamą vienos molekulės naujos kartos sekos nustatymu, MGH komanda pirmiausia ištyrė kasos vėžio pelės modelio pavyzdžius ir nustebo, kad palydovinė DNR buvo išreikšta daugiau nei 100 kartų daugiau nei būtų galima tikėtis normalūs audiniai. Labai padidėjusi palydovinė ekspresija taip pat buvo nustatyta pelių gaubtinės žarnos ir plaučių navikuose, o visi ištirti mėginiai buvo epitelio vėžys, labiausiai paplitęs kietojo naviko tipas.
Žmogaus naviko mėginių analizė davė panašius rezultatus, kai daugumoje tirtų vėžio formų, įskaitant kasos, plaučių ir prostatos navikus, buvo stipriai išreikšti du palydovai, vadinami HSATII ir ALR. Tingas pažymi, kad padidėjusios palydovinės ekspresijos nustatymas žemesnio laipsnio navikuose rodo, kad per didelė ekspresija prasideda ankstyvoje naviko vystymosi stadijoje, o tai turi įtakos ankstyvam aptikimui.
„Vėžys vis dažniau diagnozuojamas remiantis smulkia adata atliekamomis biopsijomis, kurios duoda nedaug ląstelių, kurios turi būti teisingai identifikuojamos kaip piktybinės“, – aiškina jis. "Kai kuriuose ištirtuose mėginiuose mūsų komanda parodė, kad kasos vėžio ląstelės buvo teisingai identifikuotos remiantis palydovinės RNR ekspresija, kuri buvo žymiai didesnė nei nepiktybinėse ląstelėse. Jei tai bus patvirtinta dideliais perspektyviais klinikiniais tyrimais, palydovinės RNR ekspresija gali suteikti naują ir labai specifinis biomarkeris, susijęs su kelių tipų epitelio vėžiu.
Danielis Haberis, medicinos mokslų daktaras, MGH vėžio centro direktorius ir mokslinio darbo vyresnysis autorius, sako: „Įspūdingiausia yra tai, kad tokia dramatiška anomalija buvo atskleista tik dėl naujų galingų sekos nustatymo technologijų, leidžiančių tirti tipą. RNR, kuri anksčiau buvo išmesta. Tikimės, kad ši anomalija bus svarbus vėžio diagnozavimo biomarkeris ir taip pat atskleis bendrus vėžio vystymosi mechanizmus.